Offre de thèse : PepNeurAth

Les fibres élastiques sont constituées principalement d’élastine qui représente avec le collagène, le principal composant matriciel structural de la paroi vasculaire. Au cours du vieillissement des vaisseaux, la dégradation de l’élastine génère des peptides dérivés de l’élastine (PDE) bioactifs dont certains jouent un rôle dans le développement de nombreuses pathologies vasculaires liées à l'âge. La majeure partie des effets biologiques induits par ces PDE implique le complexe récepteur de l’élastine (CRE) et notamment sa sous-unité catalytique appelée neuraminidase-1 (NEU-1). En effet, notre équipe a notamment montré que les PDE, après fixation sur le CRE et activation de NEU-1, jouent un rôle clé dans le développement de l’athérosclérose. L’objectif de ce projet de thèse sera de développer une stratégie d’inhibition ciblant la NEU-1 (par des approches de biologie cellulaire et de biochimie) dans le cadre de cette pathologie. En effet, il s’agira d’évaluer la capacité d’une combinaison de deux peptides interférents à inhiber la dimérisation/activation de la NEU-1 et à diminuer la progression de la plaque d’athérome dans des modèles de souris d’athérosclérose.

Mots clés : Neuraminidase-1, Athérosclérose, Peptides interférents, Protéines membranaires

Offre de thèse : CARBAVASC

Les maladies cardiovasculaires représentent la principale cause de mortalité à travers le monde selon les données de l’Organisation Mondiale de la Santé. Ces pathologies constituent un problème majeur de santé publique et la compréhension des mécanismes participant à leur développement ainsi que la recherche de nouvelles approches thérapeutiques sont au centre des préoccupations. Parmi les nouvelles pistes permettant de mieux comprendre ces mécanismes, le phénomène de vieillissement moléculaire des protéines a été identifié depuis plusieurs années comme pouvant jouer un rôle primordial. Ce phénomène est caractérisé par l’ensemble des modifications chimiques, non enzymatiques, que subit une protéine tout au long de sa vie biologique, et qui altèrent progressivement ses propriétés structurales et fonctionnelles. Parmi ces modifications, on retrouve des réactions de glycation, d’oxydation ou de carbamylation. Cette dernière sera étudiée dans le cadre de ce projet. En effet, plusieurs études ont rapporté l’existence d’un lien entre protéines sériques carbamylées et l’apparition de pathologies cardiovasculaires comme l’athérosclérose ou encore la maladie coronarienne. Cette réaction est caractérisée par la fixation irréversible d’un métabolite issu principalement de la dissociation de l’urée, l’acide isocyanique, sur les groupements aminés des protéines.

Des données obtenues par notre équipe de recherche montrent que les protéines matricielles (collagène et élastine) entrant dans la composition de la paroi vasculaire sont carbamylées et que le taux de carbamylation augmente avec l’âge et dans certains contextes pathologiques comme l’insuffisance rénale chronique, connue pour favoriser cette réaction. Au sein de la paroi vasculaire, les protéines matricielles sont localisées essentiellement au niveau de la média, tunique centrale des vaisseaux, et sont en contact direct avec les cellules musculaires lisses (CML), principal type cellulaire retrouvé au niveau de la média. Au même titre que les cellules endothéliales et les cellules inflammatoires, les CML sont connues pour leur rôle primordial dans le développement des pathologies cardiovasculaires.

En effet, il a été décrit qu’au cours de l’athérosclérose, les CML subissent un changement phénotypique et perdent leur phénotype contractile, essentiel à la fonction vasculaire, au profit d’un phénotype plus migratoire et sécrétoire, voire une dédifférenciation complète vers des phénotypes de type macrophagique ou ostéoblastique. Ce phénomène perturbe grandement l’homéostasie cellulaire au sein de la paroi vasculaire et participe ainsi au processus athérosclérotique. L’objectif principal de ce projet doctoral est de déterminer si la carbamylation du collagène situé dans la média des vaisseaux peut moduler le phénotype des CML en l’orientant vers un phénotype favorisant le développement de pathologies vasculaires. Pour cela, la différenciation phénotypique sera étudiée grâce à la combinaison de plusieurs approches allant des plus courantes comme les techniques de biochimie et biologie moléculaire, d’imagerie ou de cytométrie en flux, aux plus originales comme la microscopie à force atomique. Les résultats obtenus seront confortés par l’utilisation de modèles murins d’athérosclérose. Enfin, une partie de ce projet portera sur l’identification d’un récepteur des protéines carbamylées, encore inconnu à ce jour.

Mots-clés : athérosclérose, carbamylation, cellules musculaires lisses, collagène, maladies cardiovasculaires, vieillissement matriciel et vasculaire

Pour candidater : https://www.adum.fr/as/ed/page.pl?site=edsfs

Offre de thèse : DYNAMYC

La compréhension et la caractérisation des phénomènes biologiques liés au processus de vieillissement constitue un des enjeux scientifiques majeurs actuels. Or, il a été récemment démontré que la carbamylation (= fixation d'acide isocyanique (H-N=C=O), provenant principalement de la décomposition de l'urée, sur les groupements aminés des protéines) du collagène I et de l’élastine, deux des composants majeurs de la matrice extracellulaire est une caractéristique du vieillissement chez les mammifères. Cette modification non enzymatique contribue de manière significative aux dommages structuraux et fonctionnels subis par les tissus au cours du vieillissement.

L’objectif du projet DYNAMYC est de décrypter les mécanismes responsables de ces dommages au niveau moléculaire et atomique. Nous proposons pour cela une stratégie numérique centrée principalement sur l’utilisation de la dynamique moléculaire comme modèle de calculs performants appliqué au collagène I. La finalité du plan de réalisation élaboré pour faire aboutir ce projet est de surmonter les difficultés pratiques et/ou les verrous méthodologique inhérents à l'étude in silico de la triple hélice de collagène, à savoir : (i) la très grande taille du système, (ii) l’absence de paramètres dédiés à la description de la carbamylation, et (iii) les choix de positionnement des modifications le long des chaînes constituant la triple hélice.

Ce travail théorique sera mené en partenariat étroit avec des expérimentateurs reconnus et spécialistes du domaine pour guider puis valider l’approche proposée.

Pour candidater : https://www.adum.fr/as/ed/voirproposition.pl?langue=&site=edsfs&matricule_prop=38098